18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0280 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  89.5 
 
 		 196 aa  330  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  50.87 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0086  w0003  98.28 
 
 		 112 aa  118  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  32.88 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  29.03 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  32.2 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  38.6 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  29.2 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  31.67 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  30.36 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  29.46 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  33.04 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  28.12 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  31.82 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  35.82 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  23.53 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>