20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0036 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  94.01 
 
 		 196 aa  322  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  49.42 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0086  w0003  93.1 
 
 		 112 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  28.23 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.23 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  27.43 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  29.46 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  31.09 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  31.3 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  27.68 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  25.66 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  26.79 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  30.68 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  34.33 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  30.12 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  26.36 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  21.74 
 
 		 229 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>