31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1745 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  41.14 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1837  hypothetical protein  31.33 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000444384 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  36.89 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4637  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0963382  hitchhiker  0.00119035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0939  hypothetical protein  28.89 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1058  hypothetical protein  28.89 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5157  hypothetical protein  33.88 
 
 		 169 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2853  putative signal peptide  29.81 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  35.51 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  31.67 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3871  hypothetical protein  33.6 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285157  normal  0.704404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1087  hypothetical protein  30.94 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  35.51 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2102  hypothetical protein  29.93 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5086  hypothetical protein  25.58 
 
 		 316 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0280  hypothetical protein  33.04 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235416  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0036  hypothetical protein  31.3 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  27.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.57 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  26.19 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003451  hypothetical protein  32.58 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.332004  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0553  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5231  hypothetical protein  31.08 
 
 		 364 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1205  hypothetical protein  27.4 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0604166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3159  hypothetical protein  27.7 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0327  hypothetical protein  28.28 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  29.87 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  37.14 
 
 		 100 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2298  hypothetical protein  26.67 
 
 		 228 aa  40.8  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>