23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0711 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  38.24 
 
 		 281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  34.07 
 
 		 286 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  29.59 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  27.34 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 338 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  30.3 
 
 		 329 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  26.6 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  31.25 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  31.3 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  34.25 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  24.47 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  24.47 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  26.6 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  34.67 
 
 		 331 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  28.04 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  28.26 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  32.84 
 
 		 329 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  26.03 
 
 		 304 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  30.43 
 
 		 355 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 1413 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  35.71 
 
 		 540 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  26.87 
 
 		 259 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>