35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3808 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21870  nuclease-like protein  33.67 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  34.39 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0132  NERD domain-containing protein  45 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0268  NERD domain protein  31.35 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4416  NERD domain protein  39.8 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  36.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  52.94 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  39.73 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  31.86 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  41.67 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  28.35 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  35.23 
 
 		 734 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  28.4 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  39.13 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  35.14 
 
 		 467 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  32.67 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  31.78 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  37.68 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  39.19 
 
 		 212 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  41.27 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  39.74 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  34.92 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  37.93 
 
 		 809 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  46.15 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  34.67 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  44.23 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  44.23 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1583  hypothetical protein  30.68 
 
 		 656 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00309667  normal  0.612487 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  31.17 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  26.53 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3067  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 656 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00164921  hitchhiker  0.00192059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  40.98 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2640  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 657 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>