34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2293 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  35.71 
 
 		 540 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  36.14 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0860  NERD domain protein  35.42 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  27.08 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  31.62 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  52.73 
 
 		 341 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  32.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  32.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  32.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  32.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  32.32 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  27.03 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  34.88 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  43.33 
 
 		 308 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  30.88 
 
 		 304 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  43.06 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2823  hypothetical protein  31.54 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00350669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  25.36 
 
 		 355 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  32.32 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  28.21 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  28 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  27.46 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  23.23 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  32.61 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  40.68 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  39.44 
 
 		 313 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  25.15 
 
 		 467 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  38.98 
 
 		 212 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  38.98 
 
 		 212 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  34.57 
 
 		 261 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  26.98 
 
 		 700 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>