23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6631 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  37.97 
 
 		 256 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2823  hypothetical protein  33.12 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00350669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  28.88 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  36.54 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  52.73 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  30.17 
 
 		 277 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5028  hypothetical protein  36.44 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.207071  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  31.97 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4518  hypothetical protein  37.33 
 
 		 236 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  35.29 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  35.37 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  40.98 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  27.82 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  28.23 
 
 		 2179 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  33.91 
 
 		 262 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  39.39 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35980  hypothetical protein  26.42 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  35.71 
 
 		 263 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  29.41 
 
 		 540 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1335  NERD domain protein  31.85 
 
 		 251 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.600147  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  37.29 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0712  hypothetical protein  38.81 
 
 		 109 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>