14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4129 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  100 
 
 
232 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0712  hypothetical protein  75.76 
 
 
109 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  36.54 
 
 
341 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  35.06 
 
 
331 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  34.51 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  24.69 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  44.64 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  43.06 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  21.8 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  33.68 
 
 
467 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  43.86 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  42.11 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  22.46 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  45.45 
 
 
277 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>