18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1989 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  39.43 
 
 
253 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  38.49 
 
 
255 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  30.3 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  26.19 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  24.02 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  34.71 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  25.93 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  27.98 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  44.64 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  25.45 
 
 
467 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  36.96 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  36.71 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  44.44 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29.82 
 
 
700 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  25 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>