14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0235 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  842    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  75.78 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  33.88 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  32.79 
 
 		 263 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  29.34 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  26.51 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  28.1 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  25.58 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  24.82 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  23.74 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  28.44 
 
 		 253 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  29.11 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  29.86 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  25.89 
 
 		 700 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>