23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2208 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  65.04 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  45.11 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  45.42 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  45.22 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  28.24 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  26.7 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  25.75 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  25.24 
 
 		 263 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  26.6 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  25.71 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  28.66 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  25.7 
 
 		 467 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  20.93 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  23.61 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  24.88 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  24.88 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  24.88 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  24.88 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  22.18 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  21.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  23.23 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>