26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3673 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  84.09 
 
 		 308 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  78.39 
 
 		 310 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  75.33 
 
 		 300 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  55.89 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  55.89 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  55.89 
 
 		 298 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  55.56 
 
 		 298 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0784  hypothetical protein  83.81 
 
 		 136 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3797  hypothetical protein  80.56 
 
 		 138 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3205  hypothetical protein  75.45 
 
 		 134 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  33.07 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  30.31 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  34.9 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  29.34 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  36.36 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  32.43 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  30.88 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  25.67 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  25.35 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  34.12 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  46.15 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  20.81 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  34.94 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  30.95 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>