13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0784 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3797  hypothetical protein  76.43 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3205  hypothetical protein  75.18 
 
 		 134 aa  202  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  89.52 
 
 		 310 aa  196  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  89.52 
 
 		 308 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  83.81 
 
 		 304 aa  187  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  78.1 
 
 		 300 aa  173  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  58.82 
 
 		 298 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  58.82 
 
 		 298 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  58.82 
 
 		 298 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  58.82 
 
 		 298 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  37.37 
 
 		 321 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  29.03 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>