25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3417 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  65.04 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  47.83 
 
 		 290 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  45.24 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  44.59 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  24.02 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  25.87 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  29.1 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  27.69 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  24.29 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  25.15 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  23.95 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  24.19 
 
 		 467 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  22.17 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  25.37 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  34.12 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  25.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  25.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  25.6 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  25.75 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  22.14 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  20.62 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  27.35 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  23.96 
 
 		 310 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>