21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4513 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  100 
 
 
257 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  35.59 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  36.45 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  31.22 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  36.9 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  31.6 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  34.11 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  28.77 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  28.66 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  34.71 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  32.95 
 
 
467 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  28.31 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  25.5 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  30.68 
 
 
288 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  28.83 
 
 
429 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  28.98 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  28.98 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  28.98 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  28.98 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  36.97 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  43.1 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>