More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1939 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 700 aa  1411    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  38.02 
 
 		 809 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  38.02 
 
 		 734 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 		 706 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  30.52 
 
 		 712 aa  207  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  29.83 
 
 		 705 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.89 
 
 		 704 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  29.89 
 
 		 704 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 		 704 aa  204  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  31.99 
 
 		 683 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 		 716 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 		 705 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  32.78 
 
 		 696 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  29.98 
 
 		 703 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  29.98 
 
 		 703 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  28.18 
 
 		 659 aa  157  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  31.73 
 
 		 708 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  30.94 
 
 		 603 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 690 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  37.92 
 
 		 465 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  31.12 
 
 		 759 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  29.66 
 
 		 737 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.46 
 
 		 696 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 752 aa  134  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.84 
 
 		 737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  27.37 
 
 		 714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.79 
 
 		 679 aa  129  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 		 710 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  28.46 
 
 		 711 aa  126  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 697 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  27.22 
 
 		 821 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  26.26 
 
 		 695 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 		 662 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  28.89 
 
 		 673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  30.54 
 
 		 717 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  31.52 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  23.11 
 
 		 819 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 695 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 685 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.9 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  22.75 
 
 		 815 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 663 aa  94.7  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 671 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.55 
 
 		 1107 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1421 aa  87.4  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.51 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  28.65 
 
 		 335 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  26.11 
 
 		 749 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  27.42 
 
 		 982 aa  79  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 706 aa  77  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 1132 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27.92 
 
 		 726 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 768 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  28.37 
 
 		 1050 aa  70.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0132  NERD domain-containing protein  33.66 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  32.46 
 
 		 1142 aa  68.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  23.49 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5127  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  24.63 
 
 		 932 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  25.68 
 
 		 630 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.57 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 1023 aa  68.2  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  22 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2565  ankyrin  28.44 
 
 		 973 aa  67.4  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00388007  normal  0.0998723 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.4 
 
 		 837 aa  67.4  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.78 
 
 		 729 aa  67  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 725 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11400  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.69 
 
 		 710 aa  67  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.27 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.1 
 
 		 729 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 763 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  48.39 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.67 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.67 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  26.79 
 
 		 1141 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  29.81 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 753 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.78 
 
 		 753 aa  64.3  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 753 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.16 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.78 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.97 
 
 		 794 aa  64.3  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 751 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 830 aa  64.3  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 678 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 795 aa  63.9  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 		 858 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 769 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 671 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 828 aa  63.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  28.47 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>