105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3067 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0497  hypothetical protein  73.62 
 
 		 653 aa  1022    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2466  hypothetical protein  82.14 
 
 		 656 aa  1143    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000584454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1583  hypothetical protein  89.02 
 
 		 656 aa  1223    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00309667  normal  0.612487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2640  serine/threonine protein kinase  80.34 
 
 		 657 aa  1132    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3067  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 656 aa  1356    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00164921  hitchhiker  0.00192059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 1413 aa  74.3  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6346  protein kinase, putative  35.64 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  23.83 
 
 		 1427 aa  58.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.03 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 338 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  31.2 
 
 		 426 aa  53.9  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  25.15 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  31 
 
 		 1376 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  26.88 
 
 		 1157 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  23.47 
 
 		 646 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 560 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.51 
 
 		 1044 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  23.78 
 
 		 519 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  26.03 
 
 		 615 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  25 
 
 		 329 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5597  hypothetical protein  28.22 
 
 		 436 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 654 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.71 
 
 		 551 aa  51.2  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 465 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1720  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 632 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 503 aa  50.4  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  22.61 
 
 		 580 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  23.53 
 
 		 323 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 646 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 		 609 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  22.58 
 
 		 502 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 642 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 335 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 615 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 		 773 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  25.88 
 
 		 331 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 322 aa  48.5  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00506  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 450 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  23.68 
 
 		 335 aa  48.5  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  33.04 
 
 		 316 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 509 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2457  serine/threonine protein kinase  21.01 
 
 		 512 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 451 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  25.25 
 
 		 583 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  22.16 
 
 		 450 aa  47.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 451 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4106  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 496 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.998471  normal  0.522407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 1406 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.35 
 
 		 747 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  23.68 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 1029 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  23.04 
 
 		 666 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2963  serine/threonine protein kinase  23.33 
 
 		 251 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000654453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.54 
 
 		 681 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5979  serine/threonine protein kinase  20.57 
 
 		 1214 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 333 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  22.28 
 
 		 668 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  24.75 
 
 		 586 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1136  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 486 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2600  protein kinase  26.32 
 
 		 629 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212031  normal  0.220118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  22.82 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1869  serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 641 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  23.91 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 765 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  22.02 
 
 		 1818 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001965  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0732353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 314 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3248  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 752 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 446 aa  45.8  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.4 
 
 		 911 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  23.59 
 
 		 658 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  22.28 
 
 		 668 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 343 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 285 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  25.35 
 
 		 736 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3080  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  20.89 
 
 		 622 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  23.68 
 
 		 618 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 543 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 761 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  22.75 
 
 		 581 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 553 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  22.3 
 
 		 626 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 780 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  28.7 
 
 		 1400 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  21.65 
 
 		 477 aa  44.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2455  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 660 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1922  serine/threonine protein kinase  21.99 
 
 		 599 aa  44.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0873798  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 		 569 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  20.83 
 
 		 700 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  21.95 
 
 		 585 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>