More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3755 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  52.65 
 
 
759 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
773 aa  1568    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  52.65 
 
 
759 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  51.91 
 
 
755 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  52.62 
 
 
867 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  52.65 
 
 
759 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  51.27 
 
 
766 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  53.22 
 
 
750 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  45.47 
 
 
832 aa  536  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
774 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
776 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  42.58 
 
 
765 aa  459  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  44.95 
 
 
1011 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
785 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 
763 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 
781 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 
775 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
707 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  36.13 
 
 
730 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  47.91 
 
 
785 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
758 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
444 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
861 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
503 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 
646 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  33.8 
 
 
406 aa  110  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 
642 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
729 aa  107  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.66 
 
 
551 aa  107  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 
718 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 
614 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
416 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.91 
 
 
403 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0423  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
668 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
776 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 
666 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
625 aa  105  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
646 aa  104  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
517 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.21 
 
 
607 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.8 
 
 
562 aa  103  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 
573 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.05 
 
 
692 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
615 aa  102  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.31 
 
 
863 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
673 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.05 
 
 
648 aa  101  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
1104 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.62 
 
 
700 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
691 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
590 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  32.96 
 
 
618 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  31.14 
 
 
414 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
414 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  31.8 
 
 
951 aa  100  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  31.14 
 
 
414 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 
381 aa  100  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
590 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
624 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.47 
 
 
747 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  31.5 
 
 
597 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
624 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.75 
 
 
602 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
624 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
774 aa  99  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
588 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
437 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.48 
 
 
584 aa  98.6  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
632 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 
707 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.25 
 
 
638 aa  97.8  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
464 aa  97.8  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
636 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.74 
 
 
603 aa  97.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
540 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.21 
 
 
693 aa  96.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
612 aa  97.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
763 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  26.88 
 
 
565 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
651 aa  96.3  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
612 aa  96.3  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
497 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.59 
 
 
1183 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.29 
 
 
625 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.09 
 
 
620 aa  96.3  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  34.27 
 
 
554 aa  95.9  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
403 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
582 aa  95.9  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
403 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.74 
 
 
668 aa  95.5  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
405 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.69 
 
 
601 aa  95.9  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 
562 aa  95.1  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.22 
 
 
613 aa  95.5  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.84 
 
 
505 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
596 aa  95.1  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
502 aa  95.1  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  29.04 
 
 
412 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  27.85 
 
 
637 aa  94.7  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.37 
 
 
653 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>