147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2466 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0497  hypothetical protein  73.19 
 
 		 653 aa  1015    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1353    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000584454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1583  hypothetical protein  82.75 
 
 		 656 aa  1159    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00309667  normal  0.612487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2640  serine/threonine protein kinase  78.41 
 
 		 657 aa  1101    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3067  serine/threonine protein kinase  82.14 
 
 		 656 aa  1143    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00164921  hitchhiker  0.00192059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 1413 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6346  protein kinase, putative  38.96 
 
 		 473 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  27.33 
 
 		 1376 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  23.83 
 
 		 1427 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 646 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 450 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2457  serine/threonine protein kinase  21.4 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 314 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  30.83 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1720  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 632 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.314781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 780 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 652 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  23.31 
 
 		 588 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1869  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 		 641 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 292 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  23.31 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.71 
 
 		 551 aa  52  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.22 
 
 		 614 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.6 
 
 		 602 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 		 335 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  26.09 
 
 		 323 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 707 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 654 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 328 aa  51.2  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 322 aa  50.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 		 614 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3720  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 636 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00169428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  27.67 
 
 		 643 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  22.62 
 
 		 580 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  33.12 
 
 		 484 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2600  protein kinase  28.5 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212031  normal  0.220118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  30.91 
 
 		 316 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 		 642 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 761 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 599 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 333 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 646 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 		 1818 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.39 
 
 		 499 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5979  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 1214 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 559 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 1104 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5597  hypothetical protein  25.15 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 		 335 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.79 
 
 		 653 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  22.9 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 617 aa  49.3  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  26.97 
 
 		 323 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 1029 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  24.36 
 
 		 625 aa  48.5  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 560 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05511  conserved hypothetical protein  27.84 
 
 		 429 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0788501  normal  0.260345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  23.68 
 
 		 335 aa  48.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 343 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 341 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  24.74 
 
 		 620 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 341 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  24.7 
 
 		 477 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 354 aa  47.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 522 aa  47.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 1406 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 765 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.17 
 
 		 598 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  24.88 
 
 		 331 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 314 aa  47.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4106  Serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 496 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.998471  normal  0.522407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 617 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 554 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  36 
 
 		 762 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 		 773 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4533  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.69 
 
 		 710 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0634417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2084  Serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 643 aa  47.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000649074  unclonable  0.000000262207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  28.38 
 
 		 315 aa  47.4  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0317  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 529 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.149015  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  24.26 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 353 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  24.38 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.14 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.5 
 
 		 700 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1922  serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0873798  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2455  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 660 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 619 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.07 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  24.38 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  24.19 
 
 		 1157 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3654  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 660 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00230151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4944  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 639 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.438728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>