More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0475 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 314 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  64.43 
 
 		 314 aa  397  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  60.55 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  56.87 
 
 		 319 aa  361  9e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  56.9 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  57.09 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  55.93 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  55.93 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  55.83 
 
 		 323 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  48.24 
 
 		 335 aa  301  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  51.4 
 
 		 335 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  49.83 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  46.79 
 
 		 340 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  47.88 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  47.23 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  48.45 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  50.57 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 		 715 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 		 687 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  39.3 
 
 		 1430 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 		 480 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 		 645 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 661 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 628 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  37.41 
 
 		 660 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 		 615 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 657 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 723 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  37.16 
 
 		 488 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 883 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 		 877 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 852 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 865 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 865 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  37.63 
 
 		 865 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  37.63 
 
 		 861 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 476 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 862 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  37.19 
 
 		 592 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 		 769 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 		 639 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 928 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 871 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1198 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 446 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 664 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 708 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 461 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 		 602 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 705 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 		 617 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 		 623 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.12 
 
 		 930 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  32.46 
 
 		 372 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 656 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  31.9 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 442 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.67 
 
 		 662 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.74 
 
 		 551 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.44 
 
 		 707 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  25.26 
 
 		 582 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 639 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 639 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.6 
 
 		 863 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 791 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 795 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 560 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.74 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 1122 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 795 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 678 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.43 
 
 		 666 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.19 
 
 		 512 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.72 
 
 		 517 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.77 
 
 		 587 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  32.17 
 
 		 666 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0986  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 		 554 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.65 
 
 		 528 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.12 
 
 		 641 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.59 
 
 		 880 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 507 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 553 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  32 
 
 		 586 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 464 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 783 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 533 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.34 
 
 		 638 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>