More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5416 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  100 
 
 
331 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  86.29 
 
 
333 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  66.77 
 
 
329 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  65.93 
 
 
329 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  63.12 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  35.52 
 
 
684 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000011  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
716 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2378  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 
661 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3843  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
708 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0921  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
685 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
711 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0466  Serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
713 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  31.73 
 
 
672 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 
1479 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00247  protein kinase  32.76 
 
 
967 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.233886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
614 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  39.11 
 
 
617 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  35.75 
 
 
1415 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
455 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
888 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
646 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  35.31 
 
 
643 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
612 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  31.66 
 
 
915 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.19 
 
 
1023 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
898 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  36.28 
 
 
951 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.92 
 
 
666 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
580 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  34.7 
 
 
642 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
938 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
611 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
985 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.87 
 
 
476 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
612 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.78 
 
 
586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
646 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.98 
 
 
662 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.84 
 
 
667 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 
612 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
450 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.55 
 
 
642 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.05 
 
 
584 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  33.33 
 
 
457 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.38 
 
 
650 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
565 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
894 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
891 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.12 
 
 
681 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0797  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
587 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367858  normal  0.015256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
596 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
625 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 
615 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.9 
 
 
601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
683 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
691 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  32.41 
 
 
519 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  34.82 
 
 
963 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
862 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.74 
 
 
627 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 
645 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.19 
 
 
668 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.67 
 
 
822 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.64 
 
 
525 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.04 
 
 
647 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.33 
 
 
693 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  35.29 
 
 
599 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
641 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
622 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 
1122 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
557 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 
798 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
919 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
638 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
1435 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.72 
 
 
736 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.82 
 
 
878 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
444 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.16 
 
 
1072 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  28.26 
 
 
654 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6663  serine/threonine protein kinase  37.73 
 
 
414 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
503 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  30.99 
 
 
403 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 
766 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  33.93 
 
 
762 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  27.46 
 
 
638 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
493 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  36.2 
 
 
623 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
613 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.45 
 
 
598 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 
460 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
776 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.29 
 
 
1072 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.48 
 
 
943 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
842 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.41 
 
 
652 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
413 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
636 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1172  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
396 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>