More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1627 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 335 aa  692    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  84.78 
 
 		 335 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  83.73 
 
 		 340 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  83.28 
 
 		 335 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  82.54 
 
 		 338 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  82.25 
 
 		 338 aa  598  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  83.89 
 
 		 340 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  81.54 
 
 		 343 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  81.96 
 
 		 335 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  77.88 
 
 		 322 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  80.07 
 
 		 292 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  57.99 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  57.99 
 
 		 341 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 		 354 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  57.71 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  53.09 
 
 		 314 aa  311  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  50.35 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  50.52 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  49.15 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.1 
 
 		 1430 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 661 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 		 715 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 		 687 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  35.22 
 
 		 660 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  34.15 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 		 628 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 		 645 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 		 928 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 723 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 		 615 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 871 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 		 769 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 657 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 		 446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 		 877 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  34.39 
 
 		 592 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 852 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  34.85 
 
 		 861 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 865 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 883 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 865 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  34.85 
 
 		 865 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 461 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 		 617 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 476 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 862 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 1198 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 639 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 708 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.91 
 
 		 930 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.47 
 
 		 707 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 623 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.95 
 
 		 551 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  31.1 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  31.56 
 
 		 373 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.93 
 
 		 662 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 602 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 524 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  25 
 
 		 582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 660 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 509 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.47 
 
 		 707 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 710 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.19 
 
 		 512 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 562 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 546 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 533 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 705 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 442 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.95 
 
 		 658 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 528 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.62 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  32.77 
 
 		 675 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 656 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  28.57 
 
 		 664 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  28.57 
 
 		 664 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 791 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 855 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 664 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  31.38 
 
 		 579 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 		 1122 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2809  Serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 		 566 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0136026  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2124  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 984 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148689  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.33 
 
 		 641 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.77 
 
 		 1044 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 985 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1833  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.58 
 
 		 982 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.465477  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0589  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 860 aa  102  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>