104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1583 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0497  hypothetical protein  73.47 
 
 		 653 aa  1022    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2466  hypothetical protein  82.75 
 
 		 656 aa  1159    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000584454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1361    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00309667  normal  0.612487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2640  serine/threonine protein kinase  80.7 
 
 		 657 aa  1138    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3067  serine/threonine protein kinase  89.02 
 
 		 656 aa  1223    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00164921  hitchhiker  0.00192059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 		 1413 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.74 
 
 		 476 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3503  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  24.41 
 
 		 1427 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 590 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6346  protein kinase, putative  34.65 
 
 		 473 aa  56.6  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  25.35 
 
 		 615 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 338 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  23.78 
 
 		 592 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  27.18 
 
 		 1157 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0913  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 615 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.754008 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  31 
 
 		 1376 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  23.22 
 
 		 314 aa  52  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  25.73 
 
 		 329 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1332  serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 609 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.35 
 
 		 1044 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  23.87 
 
 		 502 aa  51.2  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 		 1406 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 646 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 353 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 		 322 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  23.17 
 
 		 585 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  25 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  25.62 
 
 		 329 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  24.16 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 451 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 335 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1136  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.39 
 
 		 486 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 560 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 465 aa  48.5  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3475  Serine/threonine protein kinase  21.78 
 
 		 668 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  33.06 
 
 		 316 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  24.31 
 
 		 590 aa  48.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  25.4 
 
 		 583 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  28.57 
 
 		 426 aa  47.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4533  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.53 
 
 		 710 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0634417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 		 292 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3119  protein kinase  21.78 
 
 		 668 aa  47.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0323879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  22.78 
 
 		 519 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  24.03 
 
 		 335 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.9 
 
 		 655 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 654 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 761 aa  47.4  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 333 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.88 
 
 		 911 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.66 
 
 		 586 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4221  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5817  serine/threonine protein kinase  21.46 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4246  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.54 
 
 		 551 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.96 
 
 		 661 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4096  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 1029 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2457  serine/threonine protein kinase  20.5 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5597  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.15 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 581 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  24.57 
 
 		 707 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5979  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 1214 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.18 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  21.94 
 
 		 646 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  28.7 
 
 		 1400 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  22.75 
 
 		 335 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  22.17 
 
 		 583 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1922  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 		 599 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0873798  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05511  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0788501  normal  0.260345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.44 
 
 		 747 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  22.5 
 
 		 323 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  23.79 
 
 		 565 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00506  serine/threonine protein kinase  22.79 
 
 		 450 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  21.88 
 
 		 450 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  24.03 
 
 		 343 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  24.86 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  22.52 
 
 		 614 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  22.61 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.17 
 
 		 499 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  23.9 
 
 		 331 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  24.08 
 
 		 586 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  26.53 
 
 		 1167 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  24.46 
 
 		 618 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2681  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 		 1273 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344562  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  22.3 
 
 		 626 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 871 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2809  Serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 		 566 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0136026  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  20.1 
 
 		 642 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  25.49 
 
 		 323 aa  44.3  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28119  Suppressor of Sensor Kinase (SLN1)  32.43 
 
 		 1425 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.261417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 		 554 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>