More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0106 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  100 
 
 
458 aa  940    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  40.22 
 
 
620 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  42.01 
 
 
457 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  49.76 
 
 
825 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  37.64 
 
 
628 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
543 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  39.48 
 
 
869 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 
498 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 
750 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 
585 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  39.78 
 
 
907 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  44.02 
 
 
866 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  46.12 
 
 
425 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
439 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35 
 
 
681 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.85 
 
 
747 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  42.25 
 
 
562 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  34.15 
 
 
661 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.9 
 
 
863 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
360 aa  167  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  34.75 
 
 
618 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  36.65 
 
 
565 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
573 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  32.99 
 
 
638 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.29 
 
 
627 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.91 
 
 
650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  35.51 
 
 
561 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 
645 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
700 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  37.37 
 
 
1018 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  35.47 
 
 
599 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  35.17 
 
 
574 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.16 
 
 
598 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.92 
 
 
1373 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.19 
 
 
916 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
776 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  36.7 
 
 
626 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
612 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
537 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
571 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  36.52 
 
 
1057 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  34.89 
 
 
703 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1881  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.52 
 
 
553 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.58 
 
 
602 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.87 
 
 
658 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 
691 aa  160  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
613 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  36.75 
 
 
687 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.41 
 
 
625 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.36 
 
 
1053 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 
624 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  34.34 
 
 
614 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.22 
 
 
627 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 
624 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  33.71 
 
 
586 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 
624 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4569  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.09 
 
 
655 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.967984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.59 
 
 
1036 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
569 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 
700 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
673 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.98 
 
 
642 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  38.94 
 
 
625 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  33.71 
 
 
583 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
520 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
646 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  38.06 
 
 
1032 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.94 
 
 
579 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  37.55 
 
 
820 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
632 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 
661 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 
666 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  33.21 
 
 
692 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.72 
 
 
850 aa  156  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  38.06 
 
 
1032 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  38.46 
 
 
625 aa  156  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.51 
 
 
614 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
990 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  33.92 
 
 
454 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
1085 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.91 
 
 
604 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  37 
 
 
586 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
973 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 
615 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.98 
 
 
681 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.77 
 
 
511 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
691 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  36.09 
 
 
593 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  38.63 
 
 
618 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  32.97 
 
 
597 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.75 
 
 
648 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.57 
 
 
601 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  36.1 
 
 
781 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 
969 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  38.12 
 
 
658 aa  154  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  39.32 
 
 
651 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
480 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
601 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>