More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0707 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 292 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  96.58 
 
 		 322 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  84.19 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  83.85 
 
 		 340 aa  517  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  83.51 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  80.07 
 
 		 335 aa  508  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  81.79 
 
 		 338 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  82.47 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  81.79 
 
 		 338 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  80.77 
 
 		 340 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  83.68 
 
 		 335 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  60 
 
 		 323 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  60.15 
 
 		 353 aa  332  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  59.25 
 
 		 354 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  59.62 
 
 		 341 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  59.62 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  53.05 
 
 		 314 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  51.53 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  50.57 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 		 1430 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 715 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 661 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 687 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  34.67 
 
 		 660 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 628 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 480 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 		 645 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  32.97 
 
 		 488 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 723 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 639 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 476 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 		 615 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 		 871 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 		 769 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 		 617 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  35.45 
 
 		 592 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 877 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  33.45 
 
 		 861 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 883 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 		 852 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 865 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 		 928 aa  128  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 865 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  33.45 
 
 		 865 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 461 aa  125  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 862 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.8 
 
 		 707 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 623 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.78 
 
 		 930 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.52 
 
 		 662 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  28.79 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 		 509 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.36 
 
 		 551 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 1198 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  29.28 
 
 		 373 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.88 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 708 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.4 
 
 		 707 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 569 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 752 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.49 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 507 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  25.3 
 
 		 582 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 442 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 		 710 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 471 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 602 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 528 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 776 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 673 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.52 
 
 		 596 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 656 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 546 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 418 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.02 
 
 		 638 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 419 aa  95.9  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  35.26 
 
 		 524 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.51 
 
 		 645 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 746 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  29.96 
 
 		 604 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.24 
 
 		 505 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.51 
 
 		 520 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 562 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  31.92 
 
 		 664 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  31.92 
 
 		 664 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  30.12 
 
 		 621 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 560 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 		 510 aa  92  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0589  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 860 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 855 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 464 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 705 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 		 652 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>