More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0961 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 		 911 aa  1881    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.24 
 
 		 841 aa  330  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.11 
 
 		 971 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.51 
 
 		 854 aa  284  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1389  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 752 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214576  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.47 
 
 		 986 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001965  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 450 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0732353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1626  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 941 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1619  serine/threonine protein kinase  38.67 
 
 		 941 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337467  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  30.57 
 
 		 426 aa  174  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00506  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 		 450 aa  173  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.81 
 
 		 650 aa  157  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0118  putative protein kinase  28.61 
 
 		 446 aa  155  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  34.56 
 
 		 625 aa  155  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 		 706 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 		 625 aa  153  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 624 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 624 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 624 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 651 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  34.81 
 
 		 662 aa  150  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2849  tyrosine protein kinase  27.63 
 
 		 975 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.272735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.68 
 
 		 625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  34.14 
 
 		 703 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 842 aa  148  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  34.01 
 
 		 614 aa  147  9e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 		 666 aa  147  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  32.36 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  33.33 
 
 		 625 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  33.11 
 
 		 621 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.11 
 
 		 664 aa  145  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.07 
 
 		 445 aa  144  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 537 aa  144  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.78 
 
 		 584 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 691 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.43 
 
 		 681 aa  143  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 		 582 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.63 
 
 		 627 aa  143  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 650 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.44 
 
 		 662 aa  142  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.66 
 
 		 757 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.68 
 
 		 1262 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  33.9 
 
 		 641 aa  142  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.57 
 
 		 587 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 653 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.09 
 
 		 822 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  32.76 
 
 		 626 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 695 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.58 
 
 		 798 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.54 
 
 		 661 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.49 
 
 		 620 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 464 aa  138  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  31.13 
 
 		 597 aa  138  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.29 
 
 		 601 aa  138  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.83 
 
 		 700 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 691 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 969 aa  137  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  28.95 
 
 		 667 aa  137  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 451 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 455 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 381 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.46 
 
 		 579 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.19 
 
 		 638 aa  137  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.84 
 
 		 693 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.49 
 
 		 1023 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 938 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 612 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 		 641 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.55 
 
 		 647 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.68 
 
 		 627 aa  135  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  31.29 
 
 		 668 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  30.45 
 
 		 618 aa  135  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  35.71 
 
 		 604 aa  135  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.87 
 
 		 668 aa  135  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 		 628 aa  135  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 690 aa  135  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 		 646 aa  134  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 		 559 aa  134  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.62 
 
 		 623 aa  134  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 		 503 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 746 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.51 
 
 		 769 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.61 
 
 		 668 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 615 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 		 382 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.89 
 
 		 841 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 585 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.93 
 
 		 676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 691 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.35 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  32.07 
 
 		 692 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  36.41 
 
 		 430 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 464 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 464 aa  132  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  35.48 
 
 		 431 aa  132  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.35 
 
 		 613 aa  131  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>