More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4327 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 335 aa  683    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  86.79 
 
 		 335 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  84.89 
 
 		 340 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  86.19 
 
 		 335 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  83.99 
 
 		 338 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  83.99 
 
 		 338 aa  587  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  83.59 
 
 		 340 aa  584  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  81.96 
 
 		 335 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  81.14 
 
 		 343 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  80.5 
 
 		 322 aa  544  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  83.68 
 
 		 292 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 		 353 aa  358  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  56.12 
 
 		 354 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  58.51 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  53.82 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  51.06 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  48.45 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 1430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 		 715 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 		 661 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 		 687 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  36.18 
 
 		 660 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  34.51 
 
 		 488 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 		 628 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 480 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 723 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  34.75 
 
 		 645 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 928 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  37.24 
 
 		 592 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 769 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  36.17 
 
 		 615 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 446 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 865 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 		 883 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 877 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 871 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 865 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  34.98 
 
 		 861 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 852 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  34.68 
 
 		 865 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 476 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 862 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 		 657 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 		 617 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  34.11 
 
 		 639 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 623 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.06 
 
 		 707 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.42 
 
 		 930 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.47 
 
 		 662 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 708 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  31.56 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  31.89 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  35.47 
 
 		 1198 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.89 
 
 		 512 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.99 
 
 		 551 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 710 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 		 533 aa  116  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 		 602 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  27.3 
 
 		 582 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.45 
 
 		 707 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 562 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 650 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 509 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  33.33 
 
 		 579 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 705 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 		 660 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3036  Serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 		 360 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 617 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 		 468 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 528 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 		 777 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 		 500 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 		 752 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.87 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.47 
 
 		 636 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 507 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.19 
 
 		 532 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.09 
 
 		 596 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 		 729 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 636 aa  99.4  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  28.81 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  29.88 
 
 		 526 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 1122 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>