More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0624 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  97.93 
 
 
628 aa  1120    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  100 
 
 
660 aa  1328    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  74.26 
 
 
645 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  46.25 
 
 
592 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  46.76 
 
 
769 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
723 aa  263  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  46.78 
 
 
877 aa  263  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  46.78 
 
 
865 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
852 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  46.78 
 
 
865 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  46.78 
 
 
883 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  46.78 
 
 
861 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  46.78 
 
 
865 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  39.78 
 
 
488 aa  259  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  45.89 
 
 
480 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 
862 aa  257  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  46.94 
 
 
661 aa  254  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  46.28 
 
 
657 aa  253  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  46 
 
 
687 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  45.64 
 
 
639 aa  239  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 
1430 aa  200  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  39.52 
 
 
715 aa  197  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
353 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
314 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  36.77 
 
 
319 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
354 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
341 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
341 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  37.67 
 
 
315 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  35.82 
 
 
323 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
322 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  35.93 
 
 
340 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
343 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
338 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
338 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
335 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  36.59 
 
 
340 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  35.23 
 
 
335 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
314 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
615 aa  158  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
335 aa  158  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
446 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  35.89 
 
 
928 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
335 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
871 aa  149  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  33.79 
 
 
582 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
1198 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
292 aa  139  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
461 aa  137  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.01 
 
 
707 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
602 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
349 aa  130  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
546 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 
708 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
664 aa  125  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  32.59 
 
 
372 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
380 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
623 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
617 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  31.63 
 
 
373 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
373 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.06 
 
 
930 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 
774 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.91 
 
 
662 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  26.43 
 
 
620 aa  105  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.19 
 
 
518 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
442 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
445 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
770 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
652 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
509 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
632 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.66 
 
 
586 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
560 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
554 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
656 aa  99.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
520 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  29.88 
 
 
687 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  32.93 
 
 
531 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  32.63 
 
 
653 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 
273 aa  96.3  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
587 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.33 
 
 
1072 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
533 aa  94.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 
982 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
705 aa  94.4  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.47 
 
 
1072 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.08 
 
 
650 aa  94  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.27 
 
 
737 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  29.54 
 
 
484 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.18 
 
 
551 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
573 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.3 
 
 
518 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.52 
 
 
596 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  28.63 
 
 
462 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 
916 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
621 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>