More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0215 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 723 aa  1424    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  50.37 
 
 		 883 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  50.87 
 
 		 865 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  50.87 
 
 		 861 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  56.01 
 
 		 769 aa  354  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  49.88 
 
 		 865 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  49.88 
 
 		 865 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  56.65 
 
 		 877 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  51.96 
 
 		 852 aa  350  8e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  49.14 
 
 		 862 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  54.09 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  60.42 
 
 		 592 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  52.75 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  53.68 
 
 		 687 aa  309  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  53.38 
 
 		 661 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  42.79 
 
 		 645 aa  293  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 		 628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  39.41 
 
 		 660 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  48.81 
 
 		 657 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  48.43 
 
 		 639 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  48 
 
 		 488 aa  252  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 		 1430 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 715 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 314 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 		 319 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 461 aa  174  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 928 aa  173  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 446 aa  170  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 354 aa  165  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 315 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 615 aa  162  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 353 aa  160  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 314 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 		 322 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 335 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  36.05 
 
 		 372 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 		 343 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  34.39 
 
 		 373 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 		 335 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 341 aa  153  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  35.6 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  35.36 
 
 		 335 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 		 373 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 871 aa  150  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 		 335 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 		 340 aa  148  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  34.87 
 
 		 323 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 338 aa  146  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 		 708 aa  145  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  34.02 
 
 		 340 aa  144  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 		 602 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 		 1198 aa  140  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 623 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 		 292 aa  137  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 349 aa  137  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 		 471 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 		 617 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  30.88 
 
 		 582 aa  126  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 553 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.36 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 707 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 380 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.06 
 
 		 930 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1121  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 719 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.612323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 776 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 		 766 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  28.02 
 
 		 599 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.88 
 
 		 747 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.76 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 		 273 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  33.92 
 
 		 450 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.04 
 
 		 662 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 656 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  31.05 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1104 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30.92 
 
 		 654 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  27.46 
 
 		 620 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 664 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 770 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  28.19 
 
 		 774 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  29.48 
 
 		 414 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 571 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.45 
 
 		 625 aa  104  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 581 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.03 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 650 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.2 
 
 		 850 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 543 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  32.43 
 
 		 626 aa  102  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.12 
 
 		 632 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  32.74 
 
 		 477 aa  101  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 403 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 530 aa  101  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 403 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 405 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.427583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>