More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2448 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
476 aa  968    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  58.81 
 
 
480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  52.75 
 
 
723 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  58.39 
 
 
592 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  53.63 
 
 
877 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  52.94 
 
 
865 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
865 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
883 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
865 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  52.94 
 
 
861 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
852 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  52.61 
 
 
769 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  52.25 
 
 
862 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  47.2 
 
 
687 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
645 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  46.1 
 
 
628 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  46.1 
 
 
660 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  48.43 
 
 
657 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  45.23 
 
 
488 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  48.08 
 
 
639 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
1430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  37.62 
 
 
315 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
314 aa  193  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  40.41 
 
 
715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
319 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
341 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
341 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  33.1 
 
 
323 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
343 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 
354 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
335 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
322 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  34.57 
 
 
340 aa  156  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
338 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
340 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
338 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 
446 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 
353 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
615 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  33.54 
 
 
335 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
461 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  33.23 
 
 
335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 
871 aa  143  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
1198 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
708 aa  137  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  35.13 
 
 
928 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  29.33 
 
 
582 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 
373 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  33.22 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  33.22 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
656 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
602 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
349 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
623 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.04 
 
 
662 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.34 
 
 
930 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
664 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
560 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
499 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.77 
 
 
707 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  29.96 
 
 
774 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
553 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 
273 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
752 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
546 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  26.48 
 
 
620 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
777 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
476 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
771 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.17 
 
 
587 aa  96.7  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
646 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
642 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  29.86 
 
 
519 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  30.87 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 
505 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.79 
 
 
586 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.05 
 
 
551 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
558 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.67 
 
 
728 aa  92  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
862 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  31.43 
 
 
762 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
418 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
585 aa  90.5  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0589  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
860 aa  90.1  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
938 aa  90.5  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.72 
 
 
632 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
587 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
1104 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.57 
 
 
650 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>