More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3838 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
687 aa  1367    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  75.93 
 
 
661 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  53.68 
 
 
723 aa  309  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  47.56 
 
 
865 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
865 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
883 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
865 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
852 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  49.83 
 
 
877 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  50 
 
 
861 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  50.17 
 
 
769 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  47 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
862 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  51.38 
 
 
657 aa  273  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 
639 aa  270  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  47.52 
 
 
488 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  52.26 
 
 
592 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  48 
 
 
645 aa  258  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  47.2 
 
 
476 aa  257  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  46 
 
 
628 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  46 
 
 
660 aa  250  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  42 
 
 
1430 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  39.95 
 
 
715 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 
314 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  40.13 
 
 
315 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
615 aa  193  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  37.09 
 
 
928 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
319 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
446 aa  180  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
871 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
314 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
335 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
322 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 
343 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
335 aa  167  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
340 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
338 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  35.02 
 
 
340 aa  164  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
338 aa  164  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
341 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
341 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
335 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  34 
 
 
335 aa  162  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
354 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
353 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  34.88 
 
 
323 aa  157  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
602 aa  157  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  34.39 
 
 
372 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
292 aa  153  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  33.44 
 
 
373 aa  151  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
349 aa  150  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  34.08 
 
 
373 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
1198 aa  146  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
553 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
708 aa  140  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
471 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.6 
 
 
707 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
380 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  29.79 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
546 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 
623 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
617 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  31.99 
 
 
774 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 
543 aa  123  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.23 
 
 
662 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.99 
 
 
620 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
664 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
656 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
569 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.83 
 
 
930 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 
499 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
771 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
774 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
752 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.63 
 
 
641 aa  115  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
673 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.68 
 
 
863 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
591 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
776 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
587 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
470 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.06 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
528 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  32.06 
 
 
762 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
273 aa  112  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2690  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
435 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
560 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.52 
 
 
551 aa  111  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  31.12 
 
 
477 aa  111  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  31.1 
 
 
692 aa  110  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.06 
 
 
696 aa  110  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0464  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
582 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
642 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
602 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>