More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3129 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  94.62 
 
 		 372 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 373 aa  752    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  99.2 
 
 		 373 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 1430 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 715 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 		 723 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 		 687 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 883 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  37.06 
 
 		 861 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 865 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 865 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  37.06 
 
 		 865 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 852 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 		 877 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 		 862 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 		 769 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  33.23 
 
 		 657 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.8 
 
 		 662 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 1198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 		 928 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 661 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 		 871 aa  129  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 639 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.75 
 
 		 707 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  36.25 
 
 		 592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  31.77 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 602 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  33.33 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 615 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.39 
 
 		 930 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 664 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 645 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 705 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 628 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  31.63 
 
 		 660 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  32.04 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 		 617 aa  116  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  30.33 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  33.56 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 623 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 341 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  28.77 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 		 708 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 		 771 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 656 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 546 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 560 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  34.09 
 
 		 774 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32 
 
 		 622 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0219  Serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 		 563 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 509 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0464  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 582 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3310  Serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 563 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 496 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 746 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2424  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 530 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0501957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.51 
 
 		 632 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1036  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 625 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  32.92 
 
 		 352 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 		 777 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 		 750 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 553 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 		 651 aa  89  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  31.02 
 
 		 500 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 554 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 		 752 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2928  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 540 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  32.2 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.56 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  31.38 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 1415 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>