More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1337 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
335 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  93.43 
 
 
335 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  89.22 
 
 
340 aa  624  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  86.98 
 
 
338 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  86.69 
 
 
338 aa  617  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  84.78 
 
 
335 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  86.32 
 
 
340 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  83.64 
 
 
343 aa  593  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  86.79 
 
 
335 aa  581  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  81.62 
 
 
322 aa  558  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  84.19 
 
 
292 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 
353 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 
341 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 
341 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 
354 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  58.16 
 
 
323 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  52.4 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  51.4 
 
 
314 aa  298  7e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  50.7 
 
 
315 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
319 aa  275  8e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
1430 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  38.23 
 
 
715 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
661 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
687 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  32.64 
 
 
488 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  34.34 
 
 
660 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
628 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 
480 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 
645 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
871 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
928 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  34.77 
 
 
723 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
446 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  34.01 
 
 
657 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 
615 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
461 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
769 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
476 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  36.49 
 
 
592 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
852 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
865 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  34.63 
 
 
861 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
883 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
877 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
865 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  34.42 
 
 
865 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
617 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
639 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
862 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.32 
 
 
930 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
707 aa  129  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  31.21 
 
 
372 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.2 
 
 
662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  31.44 
 
 
373 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
373 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 
602 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
1198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
708 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.69 
 
 
551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.76 
 
 
512 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
710 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
533 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
380 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  26.28 
 
 
582 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
705 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
660 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
471 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.68 
 
 
707 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
418 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
507 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
442 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 
528 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
500 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
468 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
562 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.05 
 
 
636 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  25.8 
 
 
656 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
777 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
546 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  31.12 
 
 
579 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
522 aa  102  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3036  Serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
360 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
468 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 
752 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  30.8 
 
 
675 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.44 
 
 
532 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
646 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
419 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
791 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.08 
 
 
517 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2809  Serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
566 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0136026  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
776 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
855 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
1122 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
419 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>