More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1546 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  100 
 
 
582 aa  1137    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  34.65 
 
 
488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  34.35 
 
 
660 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
628 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 
877 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
687 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
865 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
865 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  31.02 
 
 
865 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
883 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  31.02 
 
 
861 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
852 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 
723 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
480 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
639 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
862 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
354 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
661 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  31.1 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 
315 aa  120  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
349 aa  120  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  28.01 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
341 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 
338 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
341 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  26.69 
 
 
338 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
340 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  31.25 
 
 
372 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  31.48 
 
 
323 aa  114  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
335 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
1430 aa  114  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  33.47 
 
 
373 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
373 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
335 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 
928 aa  110  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 
314 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
871 aa  109  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 
322 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  25.6 
 
 
335 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 
292 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  25 
 
 
340 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
615 aa  90.9  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 
446 aa  89.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
1198 aa  87.4  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
461 aa  86.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
664 aa  84  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
656 aa  83.6  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
705 aa  83.2  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
708 aa  81.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 
617 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
1402 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.87 
 
 
930 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  19.8 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
861 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.03 
 
 
551 aa  67  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
602 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
614 aa  64.3  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.34 
 
 
518 aa  64.7  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  27.57 
 
 
790 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
396 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.21 
 
 
518 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 
490 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.66 
 
 
707 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  25.45 
 
 
502 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
403 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
403 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
405 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
746 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.41 
 
 
533 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
673 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.33 
 
 
825 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
706 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  22.14 
 
 
442 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 
480 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0191  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
494 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
519 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.14 
 
 
650 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
519 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
444 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  31.48 
 
 
599 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 
673 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 
776 aa  57  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2285  serine/threonine protein kinase  19.54 
 
 
414 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.33 
 
 
584 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2336  serine/threonine protein kinase  19.54 
 
 
414 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 
785 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
571 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
569 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>