More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1958 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2278  serine/threonine protein kinase  99.41 
 
 		 341 aa  697    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.657438  normal  0.323559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1958  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 341 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.023746  normal  0.247779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2157  protein kinase  94.12 
 
 		 323 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2475  serine/threonine protein kinase  77.71 
 
 		 354 aa  544  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0798325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0854  serine/threonine protein kinase  78.01 
 
 		 353 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0860  serine/threonine protein kinase  58.08 
 
 		 338 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3581  serine/threonine protein kinase  58.76 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0460595  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2030  serine/threonine protein kinase  58.64 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0925  serine/threonine protein kinase  58.33 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1627  serine/threonine protein kinase  57.99 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0178037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1337  serine/threonine protein kinase  57.39 
 
 		 335 aa  358  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2707  serine/threonine protein kinase  57.53 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0813  protein kinase  57.19 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4158  protein kinase  56.7 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4327  serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 		 335 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  55.63 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  55.93 
 
 		 314 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3849  serine/threonine protein kinase  55.97 
 
 		 314 aa  332  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0707  serine/threonine protein kinase  59.62 
 
 		 292 aa  318  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.576216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0045  serine/threonine protein kinase  52.17 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3014  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 		 480 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 1430 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0624  protein kinase  35.48 
 
 		 660 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0603  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 628 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1493  putative protein kinase  34.84 
 
 		 488 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 		 715 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1466  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 		 661 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4054  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 		 645 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3838  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 		 687 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0145005  normal  0.0732464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0256  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 		 877 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 871 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 615 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0215  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 723 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2837  protein kinase  34.92 
 
 		 861 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400.1  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 865 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760518  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1202  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 883 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1781  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 865 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0451  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 852 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2962  protein kinase  34.92 
 
 		 865 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2448  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 476 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.387808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 		 461 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 		 769 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 		 928 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1598  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 		 862 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4059  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 		 657 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0519  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 639 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1612  serine/threonine protein kinase  36.48 
 
 		 708 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.927771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26690  Protein kinase  34.14 
 
 		 592 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00328654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4141  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  33.8 
 
 		 1198 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 602 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 617 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 623 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.27 
 
 		 930 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.07 
 
 		 551 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 471 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3359  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 664 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49747 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.27 
 
 		 707 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 		 705 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1546  serine/threonine protein kinase-like protein  29.07 
 
 		 582 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.69 
 
 		 662 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3424  Serine/threonine protein phosphatase-like protein  29.87 
 
 		 372 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.305204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3360  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 656 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0976665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 639 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 639 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3129  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.021779  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3866  protein kinase  29.19 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0762  Serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.239085  normal  0.269213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2290  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 560 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.770072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 710 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.91 
 
 		 521 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.16 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.87 
 
 		 596 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 1122 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 855 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 563 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.27 
 
 		 641 aa  99.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 546 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.74 
 
 		 505 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2990  Serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 442 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000108087  normal  0.539453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.74 
 
 		 707 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 524 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 		 996 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.62 
 
 		 532 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 468 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  29.02 
 
 		 462 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  30.67 
 
 		 621 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 419 aa  96.3  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1995  Serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 560 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 		 528 aa  95.9  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  31.76 
 
 		 666 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.57 
 
 		 636 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 616 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 553 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 		 500 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1213  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 638 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>