More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0106 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  100 
 
 		 323 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  65.91 
 
 		 333 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  63.12 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  65.36 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  67.87 
 
 		 329 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  33.44 
 
 		 684 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000011  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 716 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2378  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 		 661 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0921  serine/threonine protein kinase  33.92 
 
 		 685 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3843  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 		 708 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 711 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0466  Serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 713 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00247  protein kinase  36.36 
 
 		 967 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.233886  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  30.04 
 
 		 672 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 		 580 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  35.91 
 
 		 586 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.28 
 
 		 476 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.27 
 
 		 525 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.94 
 
 		 650 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 646 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 588 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.22 
 
 		 627 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  35.02 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 590 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1172  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 396 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 615 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 		 557 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 614 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  36.68 
 
 		 951 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 		 646 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.38 
 
 		 740 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  35.95 
 
 		 592 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.48 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 776 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.88 
 
 		 601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 1415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.14 
 
 		 661 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32.99 
 
 		 623 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 		 982 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 691 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.67 
 
 		 1072 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 642 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 464 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 1479 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 842 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  31.53 
 
 		 617 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 		 565 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 419 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 522 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 		 982 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 612 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  33.33 
 
 		 1057 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  34.78 
 
 		 863 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 		 636 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.27 
 
 		 675 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 703 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 617 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.05 
 
 		 553 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  35.71 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  30.99 
 
 		 672 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 		 894 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 		 691 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.7 
 
 		 642 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 		 439 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.51 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  37.71 
 
 		 1100 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30.58 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  32.33 
 
 		 736 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 		 985 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.77 
 
 		 700 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 888 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.22 
 
 		 666 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.41 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  33.62 
 
 		 1053 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  31.84 
 
 		 618 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.84 
 
 		 613 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.99 
 
 		 1072 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 915 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 562 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.08 
 
 		 693 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.14 
 
 		 681 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.78 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 		 425 aa  106  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 622 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.99 
 
 		 1076 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  30.77 
 
 		 618 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 613 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 625 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 1818 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.05 
 
 		 598 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 		 608 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 681 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 557 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.42 
 
 		 668 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 625 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 673 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.36 
 
 		 647 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.52 
 
 		 662 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>