More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5575 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
333 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  86.29 
 
 
331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  69.63 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  69.33 
 
 
329 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0106  protein kinase  65.91 
 
 
323 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  36.9 
 
 
684 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000011  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
716 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2378  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
661 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3843  serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 
708 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0921  serine/threonine protein kinase  35.26 
 
 
685 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0466  Serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
713 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
711 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1527  Serine/threonine protein kinase-like  33.33 
 
 
672 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00247  protein kinase  37.01 
 
 
967 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.233886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
614 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
1415 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
646 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
612 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  33.69 
 
 
586 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
612 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
1479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
888 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
642 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
611 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
915 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.88 
 
 
584 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
625 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
455 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 
464 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.22 
 
 
642 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
580 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 
617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
641 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  29.23 
 
 
638 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
636 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
590 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.18 
 
 
598 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.49 
 
 
476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.65 
 
 
1023 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.51 
 
 
666 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
646 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  35.71 
 
 
643 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
898 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 
565 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.01 
 
 
503 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.04 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.37 
 
 
650 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
588 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
615 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.88 
 
 
675 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  34.48 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
557 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
891 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.21 
 
 
662 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  35.4 
 
 
951 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0122  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
592 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  31.65 
 
 
736 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
439 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
938 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6663  serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 
414 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  35.4 
 
 
963 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.57 
 
 
627 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
612 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1403  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
985 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.55 
 
 
681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
703 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.82 
 
 
601 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 
894 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  36.16 
 
 
493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.25 
 
 
1072 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  33.33 
 
 
623 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
622 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
450 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.9 
 
 
459 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
618 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
647 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
683 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.3 
 
 
943 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.85 
 
 
607 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5349  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.82 
 
 
1016 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553326  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0797  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
587 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367858  normal  0.015256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.78 
 
 
653 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
645 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
636 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
776 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
862 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  31.44 
 
 
658 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  31.4 
 
 
403 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1172  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
396 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.07 
 
 
1072 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.3 
 
 
661 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30.43 
 
 
654 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.81 
 
 
667 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30.6 
 
 
668 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.27 
 
 
625 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
700 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 
513 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
557 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>