More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2161 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  50.51 
 
 
774 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  51.88 
 
 
832 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
765 aa  1556    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 
776 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
785 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  49.71 
 
 
1011 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  44.89 
 
 
781 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
759 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
759 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 
759 aa  512  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  45.14 
 
 
755 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  45.22 
 
 
766 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  44.23 
 
 
750 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 
763 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  42.21 
 
 
773 aa  455  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.29 
 
 
867 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  52.07 
 
 
785 aa  351  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
775 aa  347  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
707 aa  342  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 
730 aa  330  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
758 aa  250  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 
444 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
783 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  31.47 
 
 
951 aa  102  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
502 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.77 
 
 
1267 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.39 
 
 
406 aa  94.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.86 
 
 
1684 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 
718 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
416 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.54 
 
 
691 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.7 
 
 
403 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.12 
 
 
664 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
861 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
590 aa  91.3  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.22 
 
 
586 aa  91.3  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.45 
 
 
692 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
624 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.81 
 
 
618 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
624 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
457 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
610 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
381 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
573 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  26.01 
 
 
407 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.45 
 
 
658 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
624 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.67 
 
 
668 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.19 
 
 
1072 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 
626 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
728 aa  88.6  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 
632 aa  88.6  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  29.86 
 
 
412 aa  87.8  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 
625 aa  87.8  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
551 aa  87.8  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.21 
 
 
693 aa  87.4  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
565 aa  87.4  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.08 
 
 
1655 aa  87.4  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.24 
 
 
591 aa  87.4  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 
651 aa  87.4  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
612 aa  87.4  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
450 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  27.93 
 
 
447 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.11 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
642 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.81 
 
 
1072 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
368 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
1046 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.88 
 
 
598 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.04 
 
 
1598 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
587 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
691 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
774 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
729 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
615 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  31.23 
 
 
623 aa  85.9  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  30.66 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
646 aa  85.5  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.74 
 
 
1183 aa  85.1  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
985 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  26.75 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.34 
 
 
666 aa  85.1  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.74 
 
 
603 aa  84.7  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
776 aa  85.1  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
1818 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  26.57 
 
 
664 aa  85.1  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  26.57 
 
 
664 aa  85.1  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5419  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 
1327 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  28.53 
 
 
653 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.21 
 
 
681 aa  84.7  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.33 
 
 
700 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
863 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>