More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  100 
 
 
832 aa  1686    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  51.71 
 
 
765 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  52.72 
 
 
774 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  52.91 
 
 
1011 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 
776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
781 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  44.1 
 
 
785 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  45.44 
 
 
759 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  45.44 
 
 
759 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  45.44 
 
 
759 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  46.92 
 
 
750 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  45.2 
 
 
773 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  46.14 
 
 
766 aa  525  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  45.42 
 
 
755 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 
763 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.23 
 
 
867 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  44.73 
 
 
785 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 
730 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 
707 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
775 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  36.16 
 
 
758 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  33.24 
 
 
444 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
861 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.84 
 
 
1267 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.4 
 
 
1607 aa  94  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.7 
 
 
1060 aa  92.8  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.37 
 
 
1190 aa  91.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
425 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.87 
 
 
614 aa  90.1  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5596  serine/threonine protein kinase  26.65 
 
 
649 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
551 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  31 
 
 
642 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.02 
 
 
1598 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.61 
 
 
563 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.92 
 
 
537 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
437 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  30.49 
 
 
457 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.61 
 
 
563 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
646 aa  89.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.24 
 
 
512 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
502 aa  88.6  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  31.75 
 
 
672 aa  88.2  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.97 
 
 
1398 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.76 
 
 
1609 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
855 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1611  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
1198 aa  87  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174837  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 
862 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.99 
 
 
1183 aa  87.4  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  29.66 
 
 
329 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  26.82 
 
 
641 aa  87.4  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
1340 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0423  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 
668 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
639 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.8 
 
 
1684 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
639 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 
1032 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.59 
 
 
1626 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  29.31 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
587 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  27.5 
 
 
604 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.29 
 
 
1583 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
1046 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 
718 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
892 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1435 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
895 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  29.05 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
783 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.56 
 
 
884 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33 
 
 
1617 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3858  protein kinase  27.39 
 
 
591 aa  84.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.634646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 
590 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32 
 
 
658 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  31.23 
 
 
623 aa  84  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
503 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
863 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  28.37 
 
 
625 aa  83.2  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.55 
 
 
869 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
565 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.14 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1314 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
628 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
642 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.58 
 
 
1599 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.94 
 
 
693 aa  82.4  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1858  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
922 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000651604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2455  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
660 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.52 
 
 
652 aa  82  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.6 
 
 
655 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  29.38 
 
 
951 aa  82  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
519 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.01 
 
 
728 aa  81.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
468 aa  82  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  28.23 
 
 
403 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.66 
 
 
678 aa  82  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>