More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2811 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 730 aa  1423    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  57.59 
 
 		 775 aa  735    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  44.99 
 
 		 763 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 		 785 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  40.61 
 
 		 832 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 776 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  37.71 
 
 		 774 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  37.16 
 
 		 785 aa  332  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 		 765 aa  329  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 		 1011 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 		 773 aa  303  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 		 781 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  34.93 
 
 		 766 aa  292  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 759 aa  288  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 759 aa  287  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 759 aa  287  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  34.89 
 
 		 755 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  34.39 
 
 		 750 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.37 
 
 		 867 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 		 707 aa  230  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0497  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 562 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 915 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 888 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 437 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 543 aa  98.6  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  30.77 
 
 		 457 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.66 
 
 		 623 aa  97.8  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.08 
 
 		 528 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 861 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 		 505 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0423  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 668 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0112256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  29.68 
 
 		 620 aa  95.1  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 783 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 617 aa  94.4  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000011  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 		 716 aa  94.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.39315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 		 499 aa  94.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 457 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 601 aa  94  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 691 aa  94  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 		 657 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 471 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.52 
 
 		 692 aa  93.6  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 		 729 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  30.04 
 
 		 790 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 		 360 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 		 636 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  29.64 
 
 		 687 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2336  protein kinase  28.18 
 
 		 684 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.03 
 
 		 517 aa  92  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.44 
 
 		 607 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 657 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  30.51 
 
 		 951 aa  91.3  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.74 
 
 		 551 aa  91.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 657 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 657 aa  91.3  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 		 571 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1709  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 453 aa  90.9  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.366851  normal  0.0986439 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.69 
 
 		 776 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 563 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.52 
 
 		 747 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 642 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  29.49 
 
 		 656 aa  90.1  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  31.71 
 
 		 618 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 651 aa  89.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 476 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.04 
 
 		 884 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  33.45 
 
 		 654 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.22 
 
 		 740 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  27.06 
 
 		 403 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 509 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  27.24 
 
 		 637 aa  89  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 625 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 486 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 444 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  31.85 
 
 		 599 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  34.72 
 
 		 458 aa  87.8  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  26.9 
 
 		 614 aa  87.8  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.58 
 
 		 563 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  31.12 
 
 		 457 aa  87.4  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.58 
 
 		 563 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 894 aa  87.4  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 490 aa  87.4  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.32 
 
 		 646 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 673 aa  87  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 895 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 1104 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 625 aa  86.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.07 
 
 		 668 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 		 750 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.11 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  30.93 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>