More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4405 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  52.94 
 
 
774 aa  705    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  50.51 
 
 
832 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
781 aa  1572    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  48.07 
 
 
765 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  43.45 
 
 
776 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  49.56 
 
 
1011 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  40.39 
 
 
785 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  41.82 
 
 
766 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
759 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
759 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  41.87 
 
 
755 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  41.92 
 
 
759 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  43.31 
 
 
750 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 
763 aa  443  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  40.73 
 
 
773 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  38 
 
 
867 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  41.05 
 
 
785 aa  399  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  38.06 
 
 
775 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 
707 aa  363  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
730 aa  326  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  39 
 
 
758 aa  261  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
444 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
861 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.53 
 
 
692 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
691 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
1818 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  30.61 
 
 
403 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  31.15 
 
 
951 aa  97.8  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.61 
 
 
613 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
612 aa  96.3  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
666 aa  95.5  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
468 aa  95.1  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
700 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  27.89 
 
 
638 aa  94.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 
625 aa  94  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  31.8 
 
 
661 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  28.96 
 
 
457 aa  92.8  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 
598 aa  93.2  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.72 
 
 
627 aa  92.8  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.18 
 
 
664 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  27.93 
 
 
447 aa  93.2  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  29.62 
 
 
615 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.62 
 
 
652 aa  92.8  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
615 aa  92.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
457 aa  92  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.34 
 
 
662 aa  91.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
642 aa  91.3  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
537 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  29.51 
 
 
457 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  28.92 
 
 
565 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.66 
 
 
1072 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  30.13 
 
 
623 aa  90.9  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  27.5 
 
 
637 aa  90.5  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  29.24 
 
 
625 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 
895 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.66 
 
 
476 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
862 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.66 
 
 
1072 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 
651 aa  89.7  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
596 aa  89.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
647 aa  89.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.72 
 
 
1617 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  29.51 
 
 
461 aa  89.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  29.86 
 
 
618 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
590 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
612 aa  89  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.37 
 
 
625 aa  89  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
783 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 
842 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.59 
 
 
728 aa  88.6  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
761 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  32.91 
 
 
329 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.4 
 
 
598 aa  87.8  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.05 
 
 
667 aa  87.8  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 
776 aa  87.8  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
703 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.83 
 
 
607 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  28.15 
 
 
660 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.43 
 
 
594 aa  86.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.2 
 
 
1076 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
590 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
646 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.74 
 
 
1684 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  25.18 
 
 
641 aa  86.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.18 
 
 
1607 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  27.05 
 
 
604 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
645 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.6 
 
 
648 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1267 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.72 
 
 
1598 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.47 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.61 
 
 
907 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  32.44 
 
 
329 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0032  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.7 
 
 
707 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.438373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
601 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.22 
 
 
700 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1709  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.366851  normal  0.0986439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.36 
 
 
1398 aa  85.5  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>