More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2531 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
758 aa  1481    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  43.04 
 
 
707 aa  287  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
774 aa  264  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
773 aa  262  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  42.98 
 
 
1011 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  39.04 
 
 
832 aa  249  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 
781 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 
776 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
759 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
759 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
759 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 
765 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  41.14 
 
 
766 aa  235  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  40.58 
 
 
755 aa  229  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  40.52 
 
 
750 aa  226  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  38.56 
 
 
785 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.47 
 
 
867 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 
763 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
785 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 
730 aa  171  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
775 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
861 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 
444 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 
700 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
505 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1709  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
453 aa  91.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.366851  normal  0.0986439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
604 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.9 
 
 
607 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1995  Serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 
560 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4371  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 
634 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.690427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  30.5 
 
 
519 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
642 aa  87.4  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
457 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1579  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
761 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.222846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
610 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  32.17 
 
 
653 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  29.86 
 
 
951 aa  85.1  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.67 
 
 
841 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  27.84 
 
 
623 aa  84.3  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.39 
 
 
406 aa  84  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.07 
 
 
647 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 
615 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.43 
 
 
614 aa  82.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
565 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
1122 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.42 
 
 
613 aa  82.4  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  30.42 
 
 
457 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  33.19 
 
 
597 aa  82  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.86 
 
 
403 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 
651 aa  81.6  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0201  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
729 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 
537 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.87 
 
 
700 aa  81.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.72 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
862 aa  80.9  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0204  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
679 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.998646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
746 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.22 
 
 
806 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
493 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  24.48 
 
 
662 aa  80.5  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0986  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
554 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182667  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.48 
 
 
854 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3789  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 
563 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.72 
 
 
676 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3956  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
613 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
646 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
636 aa  79.7  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  28.67 
 
 
618 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  29.56 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  26.98 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.01 
 
 
728 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2424  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.52 
 
 
986 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.918325  normal  0.204979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
776 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  33.64 
 
 
589 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0153  Serine/threonine protein kinase  25.18 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.913908  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31 
 
 
693 aa  78.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  29.26 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1121  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
719 aa  78.2  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.612323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  26.56 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
777 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
651 aa  77.8  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
418 aa  77.4  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.58 
 
 
664 aa  77.8  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>