More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3509 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1011 aa  1978    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  52.7 
 
 
832 aa  648    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  49.11 
 
 
774 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
765 aa  582  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  46.55 
 
 
776 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 
781 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
759 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
759 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  45.07 
 
 
759 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  46.8 
 
 
785 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  46.05 
 
 
755 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  45.96 
 
 
766 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  46.66 
 
 
750 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 
773 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
763 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.46 
 
 
867 aa  473  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 
775 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
730 aa  347  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  41.4 
 
 
707 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
758 aa  261  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
444 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  47.56 
 
 
785 aa  157  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
691 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.99 
 
 
692 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
861 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.12 
 
 
638 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
612 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  30.74 
 
 
951 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
666 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.14 
 
 
627 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
863 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  27.92 
 
 
664 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  27.92 
 
 
664 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.5 
 
 
551 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
703 aa  102  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  28.76 
 
 
457 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 
437 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  32.9 
 
 
646 aa  101  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.23 
 
 
598 aa  101  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.79 
 
 
664 aa  100  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
1104 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
642 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
596 aa  100  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.56 
 
 
700 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.1 
 
 
668 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  28.88 
 
 
666 aa  99.4  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.19 
 
 
650 aa  99.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.56 
 
 
693 aa  99.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.34 
 
 
647 aa  99  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  31.29 
 
 
604 aa  99  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
625 aa  99  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
587 aa  99  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.09 
 
 
662 aa  98.6  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
646 aa  98.6  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  28.96 
 
 
403 aa  98.2  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
718 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.18 
 
 
623 aa  98.2  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
892 aa  98.2  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
457 aa  98.2  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 
651 aa  98.2  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  33.22 
 
 
623 aa  97.8  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
468 aa  97.8  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1113  protein kinase  31.77 
 
 
620 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273994  normal  0.0338435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 
985 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.55 
 
 
652 aa  97.8  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  29.97 
 
 
416 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
636 aa  97.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.6 
 
 
681 aa  97.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.4 
 
 
632 aa  97.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 
636 aa  96.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 
565 aa  96.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.9 
 
 
642 aa  95.9  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.84 
 
 
579 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  32.85 
 
 
412 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.43 
 
 
613 aa  95.5  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 
691 aa  95.5  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
615 aa  95.5  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
700 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  30.58 
 
 
593 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
632 aa  95.1  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
783 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.04 
 
 
668 aa  94.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 
502 aa  94.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  28.57 
 
 
653 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.04 
 
 
627 aa  94.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
381 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  28.15 
 
 
407 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.04 
 
 
614 aa  94  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.97 
 
 
658 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.86 
 
 
621 aa  94  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
403 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
403 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
405 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  28.57 
 
 
774 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
771 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
368 aa  92.8  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.71 
 
 
728 aa  92.8  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4282  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
1145 aa  92.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.65 
 
 
602 aa  92.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
632 aa  92.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>