More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4944 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  65.95 
 
 
785 aa  793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
763 aa  1494    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  46.47 
 
 
774 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  44.82 
 
 
785 aa  545  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  46.23 
 
 
832 aa  534  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  43.97 
 
 
765 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
776 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  45.31 
 
 
775 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  47.74 
 
 
1011 aa  459  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
730 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  42.03 
 
 
781 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  43.71 
 
 
773 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 
759 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 
759 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  41.42 
 
 
755 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 
759 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  42.31 
 
 
750 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  39.29 
 
 
867 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  40 
 
 
766 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
707 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  36.42 
 
 
758 aa  191  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.9 
 
 
1626 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  29.74 
 
 
620 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.71 
 
 
1053 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.65 
 
 
551 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
700 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  30.04 
 
 
1057 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
381 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.07 
 
 
664 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  29.81 
 
 
457 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  30.18 
 
 
626 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
624 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
624 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
624 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
505 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  29.23 
 
 
502 aa  95.1  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.69 
 
 
1607 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.04 
 
 
1598 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 
646 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
490 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
425 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.16 
 
 
1267 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.85 
 
 
647 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  29.23 
 
 
403 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
871 aa  92  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
632 aa  92  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.43 
 
 
625 aa  92  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
416 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
437 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.16 
 
 
681 aa  91.7  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.62 
 
 
648 aa  91.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
1046 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.58 
 
 
1190 aa  91.3  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  27.85 
 
 
618 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
414 aa  90.9  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  31.73 
 
 
637 aa  90.1  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
457 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.98 
 
 
1398 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
718 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.06 
 
 
1684 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.48 
 
 
1609 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
360 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
652 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  29.12 
 
 
427 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.79 
 
 
700 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  30.48 
 
 
653 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
861 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.18 
 
 
635 aa  88.2  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30.58 
 
 
668 aa  88.2  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  30.36 
 
 
951 aa  87.8  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.72 
 
 
668 aa  87.8  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
285 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.54 
 
 
692 aa  87.4  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
519 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
691 aa  87.4  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.27 
 
 
1583 aa  87.4  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
783 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
519 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
1032 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  26.35 
 
 
407 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.71 
 
 
625 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
486 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 
863 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.09 
 
 
1547 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  24.82 
 
 
691 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.79 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
774 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
590 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2707  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  26.96 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0226952  unclonable  0.000000000187188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
687 aa  85.1  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
471 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.54 
 
 
676 aa  84.7  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.22 
 
 
601 aa  84.7  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
928 aa  84.7  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.99 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.73 
 
 
681 aa  84.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  27.6 
 
 
634 aa  84.3  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>