More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3080 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3080  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
348 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0114  Serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2322  serine/threonine protein kinase  42.77 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0182592  normal  0.127777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3558  serine/threonine kinase  39.47 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392756  hitchhiker  1.42072e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1153  Serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
502 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.57 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.11 
 
 
650 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
612 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.21 
 
 
604 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.52 
 
 
623 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 
468 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
651 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.67 
 
 
614 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.99 
 
 
598 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2718  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
345 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015858  normal  0.0199347 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  28.73 
 
 
621 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  29.01 
 
 
666 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  28.24 
 
 
664 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  28.24 
 
 
664 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 
891 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
625 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 
626 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.35 
 
 
662 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.42 
 
 
662 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  33.5 
 
 
1018 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  34 
 
 
1032 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.13 
 
 
869 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  33.33 
 
 
494 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  25.75 
 
 
593 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.34 
 
 
757 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.22 
 
 
715 aa  99.4  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  28.24 
 
 
634 aa  99.4  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
776 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.51 
 
 
627 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.42 
 
 
406 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  34 
 
 
1032 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 
888 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
666 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.9 
 
 
737 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  27.08 
 
 
500 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  26.94 
 
 
896 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 
746 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.45 
 
 
579 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.59 
 
 
591 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
657 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  31.25 
 
 
672 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 
862 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 
612 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.04 
 
 
798 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
587 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  25.28 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
444 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
754 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.57 
 
 
551 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 
636 aa  94  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
673 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.66 
 
 
692 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
691 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.18 
 
 
718 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  26.72 
 
 
638 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.78 
 
 
880 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
419 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 
938 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
418 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.15 
 
 
625 aa  92.8  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
646 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.55 
 
 
822 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3381  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
289 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.91 
 
 
863 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.97 
 
 
657 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.98 
 
 
878 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
657 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
464 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.44 
 
 
653 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.7 
 
 
517 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3849  serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 
355 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
746 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70266  predicted protein  25.5 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.797898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  24.81 
 
 
399 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
564 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07550  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 
568 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0745777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.54 
 
 
632 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.62 
 
 
528 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.29 
 
 
668 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  27.2 
 
 
656 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  32.71 
 
 
658 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
368 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  24.57 
 
 
455 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1338  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
602 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000158737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4174  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
243 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  25.29 
 
 
723 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
1415 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>