More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0114 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0114  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
342 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45849  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3080  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2322  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
349 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0182592  normal  0.127777 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3558  serine/threonine kinase  43.24 
 
 
348 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392756  hitchhiker  1.42072e-22 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1153  Serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 
354 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3849  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2718  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015858  normal  0.0199347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4174  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
243 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
517 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.01 
 
 
598 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6564  serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 
626 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0993188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
558 aa  95.9  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0956  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
473 aa  95.9  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
791 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.6 
 
 
584 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
646 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
583 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.07 
 
 
1053 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
464 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
468 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
571 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
642 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  28.62 
 
 
623 aa  92  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.15 
 
 
528 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  28.36 
 
 
618 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
612 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
723 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  31.48 
 
 
586 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
564 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4231  cyclic nucleotide-binding protein  28.85 
 
 
444 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
612 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
444 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  27.69 
 
 
896 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  27 
 
 
862 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
502 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  32.98 
 
 
1017 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6482  serine/threonine protein kinase  34.54 
 
 
591 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
651 aa  88.2  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30.39 
 
 
638 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1152  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
590 aa  87.8  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.351224  decreased coverage  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.1 
 
 
878 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
1009 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  32.98 
 
 
1009 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
641 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
425 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0458  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
605 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.52 
 
 
593 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04279  cell-cycle checkpoint serine-threonine kinase (Eurofung)  26.09 
 
 
630 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.631432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  30.41 
 
 
672 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
894 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  30.15 
 
 
1018 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.49 
 
 
715 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.97 
 
 
863 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  31.82 
 
 
1032 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.03 
 
 
662 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
895 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
824 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
855 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
625 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  30.81 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_924  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
877 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  31.82 
 
 
1032 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 
880 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2266  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.57 
 
 
764 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
888 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  24.57 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
498 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.23 
 
 
681 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
776 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
1479 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
645 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 
666 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  26.3 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
581 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1281  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.140436  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0575  serine/threonine-protein kinase  26.6 
 
 
934 aa  84  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  29.26 
 
 
1057 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.49 
 
 
647 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
526 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 
661 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
536 aa  83.2  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.95 
 
 
650 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
776 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_20073  predicted protein  32.68 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.542202  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
596 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
464 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.85 
 
 
718 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
602 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  28.11 
 
 
993 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  26.88 
 
 
617 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
636 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45682  predicted protein  26.09 
 
 
410 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.382803  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
746 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  27.84 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>