More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2718 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2718  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 345 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015858  normal  0.0199347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3849  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2322  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0182592  normal  0.127777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  31.91 
 
 		 869 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  31.01 
 
 		 790 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3558  serine/threonine kinase  31.72 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392756  hitchhiker  1.42072e-22 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.55 
 
 		 620 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 666 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.63 
 
 		 584 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.47 
 
 		 551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  31.39 
 
 		 1018 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0114  Serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 342 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.45849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  30.32 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 		 894 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3125  protein kinase  29.28 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 		 628 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.48 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.21 
 
 		 822 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1153  Serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 		 938 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 651 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 		 1078 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.87 
 
 		 658 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 895 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.91 
 
 		 668 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.97 
 
 		 798 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  30.07 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.16 
 
 		 1023 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 888 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 		 990 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.83 
 
 		 681 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 776 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 		 498 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4174  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 		 243 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.84 
 
 		 602 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  29.43 
 
 		 672 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3080  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.86 
 
 		 664 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.02 
 
 		 623 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  34.87 
 
 		 963 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 		 615 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.18 
 
 		 653 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.82 
 
 		 1267 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07550  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 568 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0745777 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.66 
 
 		 614 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.04 
 
 		 943 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.56 
 
 		 635 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1327  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 		 536 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0293261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 915 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.99 
 
 		 693 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  31.39 
 
 		 820 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  32.47 
 
 		 593 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1722  cyclic nucleotide-binding protein  28.06 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.107588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.59 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.45 
 
 		 769 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.34 
 
 		 662 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  31.02 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.71 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 632 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 439 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.93 
 
 		 678 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  31.64 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  29.15 
 
 		 1032 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 673 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21540  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 612 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  29.15 
 
 		 1032 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 824 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.58 
 
 		 632 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.14 
 
 		 1626 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 445 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  31.23 
 
 		 656 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.62 
 
 		 1623 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 519 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.9 
 
 		 647 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  27.82 
 
 		 654 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.25 
 
 		 647 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  29.89 
 
 		 638 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  27.05 
 
 		 641 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 661 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.46 
 
 		 907 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 691 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29 
 
 		 579 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  30.58 
 
 		 618 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 763 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 582 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 642 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2096  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  31.02 
 
 		 406 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  28.83 
 
 		 617 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 425 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>