28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0132 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0132  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0268  NERD domain protein  56.57 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21870  nuclease-like protein  43.78 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4416  NERD domain protein  46.08 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  48.21 
 
 		 331 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  38.41 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  27.6 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  33.86 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  30.19 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  34.71 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  27.04 
 
 		 429 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  32.99 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  40.58 
 
 		 734 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  34.44 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  38.89 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  41.56 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  27.37 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3742  hypothetical protein  38.67 
 
 		 178 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  44.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  37.5 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  38.03 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  35.29 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  32.43 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  27.71 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  27.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  37.66 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>