29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0268 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0268  NERD domain protein  100 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0132  NERD domain-containing protein  56.57 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4416  NERD domain protein  50.3 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21870  nuclease-like protein  40.66 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  34.97 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  32.66 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  30.95 
 
 		 540 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  34.82 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  48.39 
 
 		 700 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  36.91 
 
 		 809 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  26.32 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  27.98 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  38.96 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  40.91 
 
 		 734 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  36.84 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  24.85 
 
 		 212 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  21.74 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  42.86 
 
 		 467 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  27.52 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  40.32 
 
 		 429 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  39.66 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  37.66 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  37.7 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  37.7 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  33.87 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  37.68 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  30.19 
 
 		 185 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  27.62 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>