29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4416 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4416  NERD domain protein  100 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0268  NERD domain protein  50.26 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21870  nuclease-like protein  50.54 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0132  NERD domain-containing protein  41.11 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  32.2 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  32.79 
 
 		 700 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 809 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  40 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0442  NERD domain protein  28.74 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  37.8 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  42.86 
 
 		 734 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  41.27 
 
 		 467 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  32.89 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  42.86 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  36.78 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  36.11 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  34.72 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  27.03 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  37.18 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  31.01 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  34.33 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  35.9 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  34.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  34.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  29.27 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  36.92 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>